Siendo la operación más importante en el desarrollo del Bonsai, la poda es la técnica que nos ayudará a darle la forma deseada.
Aparte de favorecer la apariencia estética de nuestro Bonsai, servirá para manter la salud y el fortalecimiento de la planta.
La clasificación o agrupamiento de los árboles miniatura se hacen en casi todos los países de acuerdo con sus medidas, su disposición y el número de troncos creciendo desde la misma raíz.
También por la cantidad de plantas en un mismo recipiente, o la clase de base que la planta presenta.
Últimamente se han implantado ideas difíciles de corregir sobre la fertilización de los bonsai. Una es la de dejarlos sin alimento llevándolos al limite para que se mantengan chicos, otra por el contrario es la de estimularlos con mucho alimento.
Sin embargo fertilizar un Bonsai significa sobre todo tener en consideración las exigencias de la planta, aportándole las cantidades justas en el momento adecuado. Los elementos necesarios para la alimentación de una planta surgen de la tierra, el agua, y el aire, no hay que olvidar que a través de la fertilización le estamos dando los minerales adecuados para su alimentación y también hay que darles un microclima acorde con la especie.
El origen del Bonsai, como el de la mayoría de las artes tradicionales, se pierde en la compleja red tejida por el tiempo y la leyenda. Sin embargo, los recientes y diversos estudios históricos sobre el nacimiento del Bonsai coinciden en admitir que procede de China, donde se denominaba pen-jin. Este vocablo englobaba los conceptos de planta en maceta y planta miniatura.
De China, los pen-jin, que ya existían en el siglo V gracias a los intercambios comerciales y culturales, pasaron al Japón en el siglo VII. La máxima popularidad del pen-jin en China se dio en el período Sung (finales del siglo X al XIII). En esta época, una secta Zen volvió a introducirlos en Japón y las modificaciones y características propias que les imprimió el carácter japonés, acabaron por transformar el pen-jin en Bonsai.